Oui pour le rétro à l'époque j'avais fais plus d'affaires au quartier electro d'Osaka (Denden Town) qu'à Tokyo mais bon c'était en 2013...
Après comme dit mimy les books off ou bien les Mandarake de villes plus petites ont toujours des occasions qui valent le coup en furetant.
Attention dans les guides tu verras souvent Koya San comme endroit recommandé, et au final il y a que des gaijins qui vont là-bas (ma belle famille n'a pas compris pourquoi on allait la bas lors de notre premier séjour...)
Le côté temple avec moines ne vaut pas le détour en train je trouve.
En ville que j'avais beaucoup aimé aussi c'est Hiroshima qui dégage une ambiance très particulière (le musée est très dur emotionnellement) et le Okonomiyaki village vaut le détour niveau bouffe